哈尔滨医科大学附属第一医院始建于1949年，在哈尔滨卫戍医院原址上建立，最初命名为“哈尔滨医科大学附属医院”，1954年改名为“哈尔滨医科大学附属第一医院”。

医院具有较强的科研实力，在中国医学科学院“中国医院科技影响力综合排行”中进入全国前五十名。教育部肝脾外科重点实验室、国家卫健委细胞移植重点实验室、国家卫健委干细胞临床研究机构、省心血管病生光电磁诊疗重点实验室、省血液与造血系统重点实验室、省眼科基础及临床转化研究重点实验室、省普通高校神经外科重点实验室等均设在医院。通过ISO医学实验室质量和能力评估认证，是全国首批“医疗机构抗菌药物管理评价研究基地”。医院发明的亚砷酸注射液被评为国家二类新药，在中国科学院2000年《科学发展报告》中被称为20世纪中国十大科技发明之一，荣获2020未来科学大奖“生命科学奖”、“吴阶平-保罗▪杨森”医学药学奖。医院研制的双黄连制剂获省政府优秀成果奖。

医院坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入贯彻党的二十大会议精神，认真落实党中央、国务院决策部署，不断加强党对公立医院的全面领导，坚持社会主义办院方向、贯彻落实党委领导下的院长负责制，坚持公立医院公益属性、始终以人民健康为中心，坚持健康中国战略，持续深化改革创新，建立健全现代医院管理制度，重视社会主义核心价值观教育，着力加强基层党组织、精神文明、医德医风和医院文化建设，牢牢把握公立医院高质量发展的战略机遇期，以改革创新为动力推进公立医院高质量发展，发挥绩效考核、评审评价的“指挥棒”作用，推动医院“三个转变、三个提高”。

医院大力弘扬习近平总书记提出的“敬佑生命、救死扶伤、甘于奉献、大爱无疆”职业精神，发扬“生命至上，举国同心，舍生忘死，尊重科学，命运与共”的伟大抗疫精神，秉承“团结、奉献、敬业、创新”的院训，以“教书育人，为人师表，服务病人，诚信为本”为办院宗旨，以“专科有特色、专家有特长”为发展方向，坚持“人民至上、生命至上”，以高尚的医德、精湛的医术和严谨的医风，为创建国内一流、国际有影响的社会主义现代化强院而努力奋斗。